MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	GAA	3	9	371	379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617343
2	NC_017645	TTG	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617343
3	NC_017645	GCA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617343
4	NC_017645	GAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617343
5	NC_017645	AAAAG	2	10	642	651	80 %	0 %	20 %	0 %	386617343
6	NC_017645	AAG	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617343
7	NC_017645	AAGA	2	8	710	717	75 %	0 %	25 %	0 %	386617343
8	NC_017645	CGA	2	6	850	855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617343
9	NC_017645	ACA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617343
10	NC_017645	GAT	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617344
11	NC_017645	GCCA	2	8	936	943	25 %	0 %	25 %	50 %	386617344
12	NC_017645	GCCCT	2	10	949	958	0 %	20 %	20 %	60 %	386617344
13	NC_017645	AGC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617344
14	NC_017645	GGC	2	6	1133	1138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617344
15	NC_017645	ACC	2	6	1143	1148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617344
16	NC_017645	CAAAGA	2	12	1189	1200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386617345
17	NC_017645	AAGA	2	8	1271	1278	75 %	0 %	25 %	0 %	386617345
18	NC_017645	ACT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
19	NC_017645	GGTGAA	2	12	1408	1419	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386617345
20	NC_017645	GCCA	2	8	1420	1427	25 %	0 %	25 %	50 %	386617345
21	NC_017645	GAA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617345
22	NC_017645	ATC	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
23	NC_017645	TGA	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617345
24	NC_017645	TCA	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
25	NC_017645	CTT	2	6	1702	1707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617345
26	NC_017645	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617345
27	NC_017645	ACC	2	6	1724	1729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617345
28	NC_017645	ACT	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
29	NC_017645	GCTC	2	8	2008	2015	0 %	25 %	25 %	50 %	386617345
30	NC_017645	TCA	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
31	NC_017645	ACG	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617345
32	NC_017645	CAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617345
33	NC_017645	AGC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617345
34	NC_017645	CAT	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617345
35	NC_017645	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617345
36	NC_017645	AT	3	6	2637	2642	50 %	50 %	0 %	0 %	386617346
37	NC_017645	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	386617346
38	NC_017645	CA	3	6	2746	2751	50 %	0 %	0 %	50 %	386617346
39	NC_017645	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	386617346
40	NC_017645	T	7	7	3271	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	386617347
41	NC_017645	A	6	6	3280	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	386617347
42	NC_017645	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617347
43	NC_017645	ACG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617347
44	NC_017645	GATC	2	8	3393	3400	25 %	25 %	25 %	25 %	386617347
45	NC_017645	TCC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617347
46	NC_017645	GAT	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617347
47	NC_017645	AACG	2	8	3435	3442	50 %	0 %	25 %	25 %	386617347
48	NC_017645	ACC	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617347
49	NC_017645	ACTC	2	8	3503	3510	25 %	25 %	0 %	50 %	386617347
50	NC_017645	TGCCAA	2	12	3545	3556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617347
51	NC_017645	ATCC	2	8	3627	3634	25 %	25 %	0 %	50 %	386617347
52	NC_017645	A	7	7	3691	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	386617347
53	NC_017645	ATCA	2	8	3727	3734	50 %	25 %	0 %	25 %	386617348
54	NC_017645	CCA	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617348
55	NC_017645	TCT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617348
56	NC_017645	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617348
57	NC_017645	T	8	8	3898	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	386617348
58	NC_017645	AGT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617348
59	NC_017645	ACG	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617348
60	NC_017645	CCT	3	9	4093	4101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617348
61	NC_017645	GAA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617348
62	NC_017645	TCT	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617348
63	NC_017645	TCC	2	6	4212	4217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617348
64	NC_017645	TGA	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617348
65	NC_017645	TCT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617348
66	NC_017645	TTA	2	6	4269	4274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617348
67	NC_017645	TGA	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617348
68	NC_017645	CAC	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617348
69	NC_017645	GCA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617348
70	NC_017645	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386617348
71	NC_017645	TTC	2	6	4511	4516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617348
72	NC_017645	GAC	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617348
73	NC_017645	CAT	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617348
74	NC_017645	CCA	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617348
75	NC_017645	GCA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617348
76	NC_017645	ATG	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617348
77	NC_017645	CGGAG	2	10	4715	4724	20 %	0 %	60 %	20 %	386617348
78	NC_017645	GTT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617348
79	NC_017645	ACC	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617348
80	NC_017645	ATCC	2	8	5204	5211	25 %	25 %	0 %	50 %	386617349
81	NC_017645	CAT	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617349
82	NC_017645	TGG	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617349
83	NC_017645	GAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617349
84	NC_017645	TGG	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617349
85	NC_017645	ACA	2	6	5551	5556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617349
86	NC_017645	CAT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617349
87	NC_017645	GTCAT	2	10	5819	5828	20 %	40 %	20 %	20 %	386617350
88	NC_017645	GCA	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617350
89	NC_017645	TTGG	2	8	6013	6020	0 %	50 %	50 %	0 %	386617350
90	NC_017645	TCA	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617350
91	NC_017645	GAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617350
92	NC_017645	TCT	2	6	6179	6184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617350
93	NC_017645	ATC	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617350
94	NC_017645	ATC	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617351
95	NC_017645	GTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617351
96	NC_017645	CA	3	6	6422	6427	50 %	0 %	0 %	50 %	386617351
97	NC_017645	ACCAA	2	10	6463	6472	60 %	0 %	0 %	40 %	386617351
98	NC_017645	CA	3	6	6571	6576	50 %	0 %	0 %	50 %	386617351
99	NC_017645	GTT	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617351
100	NC_017645	AAG	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617351
101	NC_017645	ATCC	2	8	6710	6717	25 %	25 %	0 %	50 %	386617351
102	NC_017645	CCT	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617351
103	NC_017645	GCC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386617352
104	NC_017645	TGG	2	6	6965	6970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617352
105	NC_017645	CAA	2	6	7002	7007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617352
106	NC_017645	CCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386617352
107	NC_017645	GGC	2	6	7268	7273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617352
108	NC_017645	GCA	2	6	7390	7395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617353
109	NC_017645	AAG	2	6	7399	7404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617353
110	NC_017645	TTC	2	6	7435	7440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617353
111	NC_017645	TTCCC	2	10	7462	7471	0 %	40 %	0 %	60 %	386617353
112	NC_017645	TGGC	2	8	7478	7485	0 %	25 %	50 %	25 %	386617353
113	NC_017645	TGC	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617353
114	NC_017645	ATG	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617353
115	NC_017645	TGG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617353
116	NC_017645	GAGCTT	2	12	7637	7648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617353
117	NC_017645	GTA	2	6	7655	7660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617354
118	NC_017645	GCTGA	2	10	7679	7688	20 %	20 %	40 %	20 %	386617354
119	NC_017645	TGA	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617354
120	NC_017645	CAAAG	2	10	7843	7852	60 %	0 %	20 %	20 %	386617354
121	NC_017645	GAG	2	6	7857	7862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617354
122	NC_017645	CCT	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617354
123	NC_017645	ACG	2	6	7887	7892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617354
124	NC_017645	AAG	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617354
125	NC_017645	GCT	2	6	7976	7981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617354
126	NC_017645	GTCAG	2	10	8063	8072	20 %	20 %	40 %	20 %	386617354
127	NC_017645	AGG	2	6	8145	8150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617354
128	NC_017645	ATG	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617354
129	NC_017645	A	6	6	8324	8329	100 %	0 %	0 %	0 %	386617354
130	NC_017645	TGA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617354
131	NC_017645	TCA	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617355
132	NC_017645	GTG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617355
133	NC_017645	TGC	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617355
134	NC_017645	TCCA	2	8	8785	8792	25 %	25 %	0 %	50 %	386617355
135	NC_017645	CAT	2	6	8931	8936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617355
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138	NC_017645	CTG	2	6	8975	8980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617355
139	NC_017645	TCA	2	6	9029	9034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617355
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141	NC_017645	CAG	2	6	9187	9192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617355
142	NC_017645	GAC	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617355
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147	NC_017645	CAT	2	6	9381	9386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617355
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155	NC_017645	TGG	2	6	9821	9826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617356
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157	NC_017645	CAAA	2	8	9876	9883	75 %	0 %	0 %	25 %	386617356
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159	NC_017645	TGG	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617356
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248	NC_017645	ACT	2	6	15610	15615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617367
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250	NC_017645	TCAGA	2	10	15695	15704	40 %	20 %	20 %	20 %	386617367
251	NC_017645	AC	3	6	15738	15743	50 %	0 %	0 %	50 %	386617367
252	NC_017645	GGA	2	6	15767	15772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617367
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256	NC_017645	TTC	2	6	16047	16052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617367
257	NC_017645	TGGC	2	8	16259	16266	0 %	25 %	50 %	25 %	386617368
258	NC_017645	TTG	2	6	16353	16358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617368
259	NC_017645	CGA	2	6	16429	16434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617368
260	NC_017645	GAG	2	6	16445	16450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617368
261	NC_017645	A	6	6	16463	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	386617368
262	NC_017645	GAA	2	6	16477	16482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617368
263	NC_017645	AAC	2	6	16490	16495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617368
264	NC_017645	AAC	2	6	16552	16557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617368
265	NC_017645	GAT	2	6	16617	16622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617368
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268	NC_017645	A	6	6	16667	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	386617368
269	NC_017645	CAT	2	6	16678	16683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617368
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289	NC_017645	CGG	2	6	18174	18179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617372
290	NC_017645	ATT	2	6	18221	18226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617372
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374	NC_017645	GCGG	2	8	23094	23101	0 %	0 %	75 %	25 %	386617378
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382	NC_017645	GGGT	2	8	23589	23596	0 %	25 %	75 %	0 %	386617378
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